在开展扫黑除恶专项斗争中，仙游县水利局成立领导小组及4个专项工作组，专题研究部署，印发实施方案，坚持重点领域全面摸排、综合治理，全面扫清黑恶死角，坚决扫除黑恶势力，构筑安全和谐稳定的水利发展环境。

守护水资源是该局扫黑除恶的重中之重。该局全面排查河道采砂、河湖“清四乱”等领域涉黑涉恶线索及行业监管漏洞，对水利系统中9类容易发生涉黑涉恶案件的重点领域进行拉网式排查，主动做好线索移交及核查协办。目前，已排查上报市水利局行业线索9条，排查出2条涉黑涉恶线索移交至县公安局扫黑办。

该局开展行业乱象专项行动，突出河湖“清四乱”，坚决打击非法采砂，禁泳禁钓，对水利工程质量、水土保持工作进行监督检查，铲除水利行业黑恶势力滋生土壤。在整治“砂霸”乱象中，该局共出动执法人员1068人次，巡查河道265次，依法拆除19个洗砂场，强制扣押非法车辆14部，行政处罚9起，处罚款32万元，涉嫌采矿罪移送公安机关办理2起。在河湖“清四乱”专项行动中，对水利部、省、市督查督办、群众反映强烈等重点部位的河流进行重点细致排查，采取“村不漏组、组不漏点”形式逐一进行登记、拍照备案，整治销号全县281处河湖“四乱”问题，整治面积22.66万平方米，促使河湖得到有效保护。该局立案查处的双溪口水库河道非法采砂一案，入选福建法院水资源司法保护十大案例。目前，双溪口水库河道生态修复工程已全面完工。